一、企業(yè)所得稅法第二十七條第一項的解讀

《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第二十七條第一款規(guī)定，企業(yè)的下列所得，可以免征、減征企業(yè)所得稅：

從事農、林、牧、漁業(yè)項目的所得：這是您公司情況中最為相關的一項。根據該條款，企業(yè)從事農、林、牧、漁業(yè)項目的所得，在符合一定條件下，可以享受免征或減征企業(yè)所得稅的優(yōu)惠。

二、具體到您公司的情況

種子繁育基地：
如果您的種子繁育基地直接從事農、林、牧、漁業(yè)項目（如蔬菜、谷物、薯類等的種植），并且這些項目符合稅法規(guī)定的免征條件，那么這些項目的所得可以享受免征企業(yè)所得稅的優(yōu)惠。
與種地大戶或合作社的合作：
您公司與種地大戶或合作社簽訂的繁育合同，并讓他們代繁種子，這部分業(yè)務在稅法上可能被視為一種合作經營模式。關鍵在于這些合作是否仍然屬于農、林、牧、漁業(yè)項目的范疇，并且是否滿足免征或減征的條件。
如果這些合作仍然屬于免征范圍（如合作種植的作物種類、種植方式等符合稅法規(guī)定），那么這部分所得也可以享受相應的稅收優(yōu)惠。

三、減征企業(yè)所得稅的情況

減征企業(yè)所得稅通常不是指減半征收，而是指按照一定比例減少應納稅所得額，從而減少企業(yè)所得稅的繳納。具體的減征比例和條件需要根據相關法律法規(guī)來確定。
在您公司的情況下，如果某些項目不符合免征條件，但符合減征條件，那么這些項目的所得將按照規(guī)定的比例減少應納稅所得額。

四、科技型中小企業(yè)的特殊優(yōu)惠

作為科技型中小企業(yè)，您公司可能還可以享受其他與科技創(chuàng)新相關的稅收優(yōu)惠政策。這些政策可能包括研發(fā)費用加計扣除、高新技術企業(yè)稅率優(yōu)惠等。

五、總結

您公司從事的種業(yè)業(yè)務中，如果直接從事農、林、牧、漁業(yè)項目并符合免征條件，那么這些項目的所得可以享受免征企業(yè)所得稅的優(yōu)惠。
與種地大戶或合作社的合作部分，如果仍然屬于免征范圍，也可以享受相應優(yōu)惠；否則，可能需要根據具體情況確定是否減征企業(yè)所得稅。
具體的稅收優(yōu)惠條件和比例需要依據相關法律法規(guī)進行確定，并建議與稅務機關求證，以獲取最準確的信息。