以下分別來分析： 關(guān)于是否有滯納金問題： 如果在5月應(yīng)該預(yù)繳但未預(yù)繳，6月報稅期在機(jī)構(gòu)所在地（當(dāng)?shù)囟悇?wù)局）繳納了本該異地預(yù)繳的稅款，如果嚴(yán)格按照稅法規(guī)定和征管流程： 1. 通常是存在未按規(guī)定預(yù)繳的問題，稅務(wù)機(jī)關(guān)有可能會認(rèn)定從應(yīng)該預(yù)繳稅款期限屆滿次日起至實際繳納稅款之日止計算滯納金。 2. 但如果當(dāng)?shù)囟悇?wù)機(jī)關(guān)在執(zhí)行過程中考慮到特殊情況（比如企業(yè)能說明合理原因、首次發(fā)生、稅務(wù)機(jī)關(guān)自身對政策宣傳輔導(dǎo)不到位等因素），且稅務(wù)機(jī)關(guān)有一定的裁量空間，也有可能不征收滯納金。 關(guān)于合同和稅率以及外經(jīng)證問題： 1. 合同與稅率不一致，如果業(yè)務(wù)實質(zhì)符合簡易計稅（比如是清包工、甲供材等符合簡易計稅的情形等），那么重新做3%稅率合同后，在合同層面和稅務(wù)處理層面基本匹配，從業(yè)務(wù)和稅務(wù)合規(guī)角度問題不大。如果業(yè)務(wù)實質(zhì)不符合簡易計稅而開了3%，則存在稅務(wù)風(fēng)險。 2. 如果后續(xù)業(yè)務(wù)還是在異地且之前的外經(jīng)證已經(jīng)使用（用于開具了3%發(fā)票等），那么通常是需要重新申請外經(jīng)證的。 3. 至于能不能開9%稅率發(fā)票，如果業(yè)務(wù)實際情況符合一般計稅方式（非簡易計稅項目），在重新申請外經(jīng)證后，按正常程序和稅務(wù)規(guī)定，是可以開具9%稅率發(fā)票的，但如果業(yè)務(wù)本身屬于簡易計稅范圍，那就不能開具9%稅率發(fā)票而只能開3%（或現(xiàn)在特殊時期的優(yōu)惠稅率等） 。如果之前錯誤地按3%開具發(fā)票且開具有誤發(fā)票已跨月等情況，建議考慮按規(guī)定沖紅后重新開具（符合條件下）。