一、這兩種系統(tǒng)的會計前提一樣，主要表現(xiàn)在：會計主體、持續(xù)經(jīng)營活動、分段和會計貨幣。會計原則，這兩個都有真實性、完整性、及時性原則、相關(guān)性原則、可比性原則、重要性原則。會計要素雖然有差異，但其內(nèi)容和方法大致一致的。
二、不同主要體現(xiàn)在：
1、會計核算基礎(chǔ)不同。企業(yè)單位會計實行的是權(quán)責(zé)發(fā)生制， 行政事業(yè)單位會計大多實行的是收付實現(xiàn)制。政府會計由預(yù)算會計和財務(wù)會計構(gòu)成。預(yù)算會計實行收付實現(xiàn)制，國務(wù)院另有規(guī)定的，依照其規(guī)定。財務(wù)會計實行權(quán)責(zé)發(fā)生制。
2、會計要素不同。事業(yè)單位會計要素分為五大類：即資產(chǎn)、負債、凈資產(chǎn)、收入和支出。企業(yè)會計要素分為六大類；即資產(chǎn)、負債、所有者權(quán)益、收入、費用和利潤。
3、會計等式不同。事業(yè)單位的會計等式是“資產(chǎn)%2B支出=負債%2B凈資產(chǎn)%2B收入”，此等式為動態(tài)等式，反映單位在業(yè)務(wù)營運過程中收支結(jié)余情況及凈資產(chǎn)的增值情況。
因為事業(yè)單位的資金來源主要是通過上級撥款取得的，所以要嚴格監(jiān)督各項支出的耗費，因此要采用動態(tài)等式，資產(chǎn)負債表也是以此等式為依據(jù)的。
企業(yè)的會計等式為“資產(chǎn)=負債%2B所有者權(quán)益”，此等式為凈態(tài)等式，反映了會計要素之間的數(shù)量關(guān)系，反映了企業(yè)資產(chǎn)的歸屬關(guān)系，表明了企業(yè)和所有者是各自獨立存在的。同時，也是編制資產(chǎn)負債表的理論依據(jù)。
4、企業(yè)會計有涉稅內(nèi)容，一般的行政事業(yè)單位因為沒有經(jīng)營業(yè)務(wù)，所以不涉及稅務(wù)，最多代收代繳一下個人所得稅。
